MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	A	6	6	67	72	100 %	0 %	0 %	0 %	260751836
2	NC_013366	CT	3	6	131	136	0 %	50 %	0 %	50 %	260751836
3	NC_013366	TAA	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751836
4	NC_013366	AT	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
5	NC_013366	ATG	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751836
6	NC_013366	GAAA	2	8	253	260	75 %	0 %	25 %	0 %	260751836
7	NC_013366	ACA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751836
8	NC_013366	TA	3	6	305	310	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
9	NC_013366	G	6	6	403	408	0 %	0 %	100 %	0 %	260751836
10	NC_013366	A	6	6	415	420	100 %	0 %	0 %	0 %	260751836
11	NC_013366	CAT	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751836
12	NC_013366	A	6	6	471	476	100 %	0 %	0 %	0 %	260751836
13	NC_013366	ATTTTA	2	12	485	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751836
14	NC_013366	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	260751836
15	NC_013366	TAAA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	260751837
16	NC_013366	AAT	2	6	548	553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
17	NC_013366	CAT	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751837
18	NC_013366	A	6	6	614	619	100 %	0 %	0 %	0 %	260751837
19	NC_013366	ATT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751837
20	NC_013366	GCT	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751837
21	NC_013366	GAT	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
22	NC_013366	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	260751837
23	NC_013366	GCA	2	6	758	763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751837
24	NC_013366	GTG	2	6	789	794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
25	NC_013366	CAC	2	6	807	812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751837
26	NC_013366	GAA	2	6	861	866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751837
27	NC_013366	TAA	2	6	883	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
28	NC_013366	TC	3	6	910	915	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
29	NC_013366	TGA	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
30	NC_013366	AAC	2	6	978	983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
31	NC_013366	AGT	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
32	NC_013366	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751837
33	NC_013366	AGC	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751837
34	NC_013366	TGG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
35	NC_013366	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751837
36	NC_013366	TTCT	2	8	1218	1225	0 %	75 %	0 %	25 %	260751837
37	NC_013366	AT	3	6	1342	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
38	NC_013366	ACA	2	6	1379	1384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
39	NC_013366	CTTT	2	8	1436	1443	0 %	75 %	0 %	25 %	260751837
40	NC_013366	GCT	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751837
41	NC_013366	GAGC	2	8	1466	1473	25 %	0 %	50 %	25 %	260751837
42	NC_013366	AGC	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751837
43	NC_013366	A	6	6	1505	1510	100 %	0 %	0 %	0 %	260751837
44	NC_013366	ACA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
45	NC_013366	GCT	2	6	1751	1756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751837
46	NC_013366	AATG	2	8	1763	1770	50 %	25 %	25 %	0 %	260751837
47	NC_013366	ATT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751837
48	NC_013366	TGC	2	6	1822	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751837
49	NC_013366	AGA	2	6	1834	1839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751837
50	NC_013366	CT	3	6	1840	1845	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
51	NC_013366	TGCT	2	8	1851	1858	0 %	50 %	25 %	25 %	260751837
52	NC_013366	AT	3	6	1981	1986	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
53	NC_013366	ACA	2	6	2038	2043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
54	NC_013366	GAA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751837
55	NC_013366	AGAA	2	8	2146	2153	75 %	0 %	25 %	0 %	260751837
56	NC_013366	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
57	NC_013366	A	6	6	2227	2232	100 %	0 %	0 %	0 %	260751837
58	NC_013366	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751837
59	NC_013366	TTG	2	6	2271	2276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751837
60	NC_013366	AACA	2	8	2285	2292	75 %	0 %	0 %	25 %	260751837
61	NC_013366	TCA	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751837
62	NC_013366	TAA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
63	NC_013366	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
64	NC_013366	A	6	6	2473	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	260751837
65	NC_013366	TATG	2	8	2479	2486	25 %	50 %	25 %	0 %	260751837
66	NC_013366	AGG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751837
67	NC_013366	ATG	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
68	NC_013366	ATG	3	9	2649	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
69	NC_013366	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
70	NC_013366	GAT	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
71	NC_013366	GAT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
72	NC_013366	TA	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
73	NC_013366	GGA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751837
74	NC_013366	GAC	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751837
75	NC_013366	TGG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
76	NC_013366	TAA	2	6	2839	2844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
77	NC_013366	AGG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751837
78	NC_013366	ATG	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
79	NC_013366	GGT	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
80	NC_013366	TGA	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
81	NC_013366	TGG	4	12	2935	2946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
82	NC_013366	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751837
83	NC_013366	TGG	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751837
84	NC_013366	TCA	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751837
85	NC_013366	AGG	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751837
86	NC_013366	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
87	NC_013366	AG	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
88	NC_013366	ATG	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
89	NC_013366	ATC	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751837
90	NC_013366	TTG	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751837
91	NC_013366	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
92	NC_013366	ATA	3	9	3303	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
93	NC_013366	TA	3	6	3326	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
94	NC_013366	A	6	6	3354	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	260751837
95	NC_013366	TAA	2	6	3394	3399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751837
96	NC_013366	ATT	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751837
97	NC_013366	TGA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751837
98	NC_013366	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
99	NC_013366	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
100	NC_013366	CA	3	6	3481	3486	50 %	0 %	0 %	50 %	260751837
101	NC_013366	CAA	2	6	3489	3494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751837
102	NC_013366	ATG	2	6	3564	3569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751838
103	NC_013366	ATA	2	6	3586	3591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
104	NC_013366	TTGC	2	8	3609	3616	0 %	50 %	25 %	25 %	260751838
105	NC_013366	ATA	2	6	3625	3630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
106	NC_013366	CA	4	8	3672	3679	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
107	NC_013366	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
108	NC_013366	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
109	NC_013366	TCA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751838
110	NC_013366	AAC	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751838
111	NC_013366	AGT	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751838
112	NC_013366	TGT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751838
113	NC_013366	AGG	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751838
114	NC_013366	TAA	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
115	NC_013366	T	8	8	4081	4088	0 %	100 %	0 %	0 %	260751838
116	NC_013366	TAT	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751838
117	NC_013366	TC	3	6	4210	4215	0 %	50 %	0 %	50 %	260751838
118	NC_013366	TAC	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751838
119	NC_013366	TTGC	2	8	4266	4273	0 %	50 %	25 %	25 %	260751838
120	NC_013366	GA	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
121	NC_013366	T	6	6	4352	4357	0 %	100 %	0 %	0 %	260751838
122	NC_013366	T	7	7	4392	4398	0 %	100 %	0 %	0 %	260751838
123	NC_013366	T	7	7	4407	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	260751838
124	NC_013366	TAT	2	6	4453	4458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751838
125	NC_013366	TGTTA	2	10	4470	4479	20 %	60 %	20 %	0 %	260751838
126	NC_013366	TTA	2	6	4503	4508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751838
127	NC_013366	TGA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751838
128	NC_013366	AATA	2	8	4580	4587	75 %	25 %	0 %	0 %	260751838
129	NC_013366	CAC	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751838
130	NC_013366	GAT	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751838
131	NC_013366	AAC	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751838
132	NC_013366	GCA	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751838
133	NC_013366	ATGG	2	8	4742	4749	25 %	25 %	50 %	0 %	260751838
134	NC_013366	GA	3	6	4771	4776	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
135	NC_013366	CAGGT	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	260751838
136	NC_013366	CAG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751838
137	NC_013366	TTC	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751838
138	NC_013366	AAT	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
139	NC_013366	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
140	NC_013366	ACG	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751838
141	NC_013366	GTA	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751838
142	NC_013366	ATA	2	6	5245	5250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
143	NC_013366	TTA	2	6	5323	5328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751838
144	NC_013366	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751838
145	NC_013366	TTG	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751838
146	NC_013366	AGG	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751838
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149	NC_013366	AGAAC	2	10	5521	5530	60 %	0 %	20 %	20 %	260751838
150	NC_013366	ATT	3	9	5535	5543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751838
151	NC_013366	CA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
152	NC_013366	A	6	6	5564	5569	100 %	0 %	0 %	0 %	260751838
153	NC_013366	AAT	2	6	5579	5584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751838
154	NC_013366	CA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
155	NC_013366	A	6	6	5640	5645	100 %	0 %	0 %	0 %	260751838
156	NC_013366	T	6	6	5740	5745	0 %	100 %	0 %	0 %	260751839
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159	NC_013366	TTC	2	6	5809	5814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751839
160	NC_013366	TGT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751839
161	NC_013366	TAT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751839
162	NC_013366	TCTCT	2	10	5898	5907	0 %	60 %	0 %	40 %	260751839
163	NC_013366	GAA	2	6	5968	5973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751839
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165	NC_013366	A	9	9	6041	6049	100 %	0 %	0 %	0 %	260751839
166	NC_013366	TGT	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751839
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168	NC_013366	TTCT	2	8	6151	6158	0 %	75 %	0 %	25 %	260751839
169	NC_013366	TAA	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751839
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171	NC_013366	A	6	6	6293	6298	100 %	0 %	0 %	0 %	260751839
172	NC_013366	AGC	2	6	6304	6309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751839
173	NC_013366	TAAA	2	8	6316	6323	75 %	25 %	0 %	0 %	260751839
174	NC_013366	A	7	7	6321	6327	100 %	0 %	0 %	0 %	260751839
175	NC_013366	AGGA	2	8	6385	6392	50 %	0 %	50 %	0 %	260751839
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177	NC_013366	A	6	6	6426	6431	100 %	0 %	0 %	0 %	260751839
178	NC_013366	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	260751839
179	NC_013366	GAA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751839
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234	NC_013366	GAA	2	6	10063	10068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751842
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251	NC_013366	CCGGG	2	10	11776	11785	0 %	0 %	60 %	40 %	260751844
252	NC_013366	ACA	2	6	11808	11813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751844
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254	NC_013366	ACA	2	6	11851	11856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751844
255	NC_013366	C	6	6	11891	11896	0 %	0 %	0 %	100 %	260751844
256	NC_013366	TAAA	2	8	11914	11921	75 %	25 %	0 %	0 %	260751844
257	NC_013366	AAAAC	2	10	11972	11981	80 %	0 %	0 %	20 %	260751845
258	NC_013366	TCA	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751845
259	NC_013366	ATT	2	6	12035	12040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751845
260	NC_013366	TTA	2	6	12059	12064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751845
261	NC_013366	CAG	3	9	12090	12098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751845
262	NC_013366	ACC	2	6	12099	12104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751845
263	NC_013366	TAA	2	6	12173	12178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751845
264	NC_013366	ATT	2	6	12222	12227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751846
265	NC_013366	ATT	2	6	12246	12251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751846
266	NC_013366	CGG	2	6	12362	12367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751846
267	NC_013366	AGA	2	6	12385	12390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751846
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269	NC_013366	GGT	2	6	12454	12459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751846
270	NC_013366	GTG	2	6	12530	12535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751846
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398	NC_013366	T	6	6	20305	20310	0 %	100 %	0 %	0 %	260751855
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